แพง
Expasyเป็นออนไลน์ชีวสารสนเทศทรัพยากรที่ดำเนินการโดยSIB สวิสสถาบันชีวสารสนเทศศาสตร์ มันเป็นขยายและบูรณาการพอร์ทัลซึ่งให้การเข้าถึงกว่า 160 ฐานข้อมูลและเครื่องมือซอฟต์แวร์และสนับสนุนช่วงของวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิตและพื้นที่การวิจัยทางคลินิกจากฟังก์ชั่น , โปรตีนและชีววิทยาโครงสร้างเพื่อวิวัฒนาการและวิวัฒนาการ , ระบบชีววิทยาและเคมีทางการแพทย์. ทรัพยากรแต่ละรายการ (ฐานข้อมูลเครื่องมือซอฟต์แวร์บนเว็บและซอฟต์แวร์ที่ดาวน์โหลดได้) โฮสต์ในลักษณะที่กระจายอำนาจโดยกลุ่มต่างๆของ SIB Swiss Institute of Bioinformatics และสถาบันพันธมิตร
เครื่องมือค้นหา
แบบสอบถามของ Expasy อนุญาต:
- การค้นหาแบบขนานฐานข้อมูล SIB ผ่านการค้นหาเพียงครั้งเดียว
- ผลการค้นหาแบบรวมจากชุดรีซอร์สทั้งหมด> 160 รายการที่สามารถเข้าถึงได้จากพอร์ทัล [1]
Expasy ให้ข้อมูลล่าสุดจากรีลีสล่าสุดของแต่ละแหล่งข้อมูล
คำที่ใช้ใน Expasy อยู่บนพื้นฐานที่ครอบคลุม Edam อภิปรัชญา [2]
ประวัติศาสตร์
Expasy ถูกสร้างขึ้นในเดือนสิงหาคมปี 1993 แต่เดิมมันถูกเรียกว่าExPASy ( ExฮึกเหิมP rotein nalysis Syต้นกำเนิด) และทำหน้าที่เป็นโปรตีนเซิร์ฟเวอร์ในการวิเคราะห์โปรตีนลำดับและโครงสร้างและสองมิติข่าวคราว (2-D หน้า electrophoresis) [3] ExPASy โฮสต์ฐานความรู้ลำดับโปรตีนUniProtKB / Swiss-Protและส่วนเสริมที่มีคำอธิบายประกอบคอมพิวเตอร์ UniProtKB / TrEMBL ก่อนที่จะย้ายไปยังเว็บไซต์UniProt [ ต้องการอ้างอิง ]
ExPASy เป็นหนึ่งในเว็บไซต์แรกของวิทยาศาสตร์ชีวภาพและเป็นหนึ่งใน 150 เว็บไซต์แรกของโลก ณ วันที่ 5 เมษายน 2550[อัปเดต]ExPASy ได้รับการปรึกษาหารือ 1 พันล้านครั้งนับตั้งแต่ติดตั้งเมื่อวันที่ 1 สิงหาคม พ.ศ. 2536 [4]
ในเดือนมิถุนายน 2554 ได้กลายเป็นพอร์ทัลทรัพยากรชีวภาพของ SIB ExPASy: แคตตาล็อกทรัพยากรชีวสารสนเทศที่หลากหลายที่พัฒนาโดย SIB Groups [5] Expasy เวอร์ชันปัจจุบันเปิดตัวในเดือนตุลาคม 2020 [6]
หมายเหตุและข้อมูลอ้างอิง
- ^ "SIB ทรัพยากร" พี่น้อง. สวิส. สืบค้นเมื่อ27 ตุลาคม 2563 .
- ^ Ison J, Kalas M, Jonassen I, Bolser D, Uludag M, McWilliam H และอื่น ๆ (พฤษภาคม 2013). "Edam: อภิปรัชญาของการดำเนินงานชีวสารสนเทศประเภทของข้อมูลและตัวระบุหัวข้อและรูปแบบ" ชีวสารสนเทศศาสตร์ . 29 (10): 1325–32. ดอย : 10.1093 / ชีวสารสนเทศศาสตร์ / btt113 . PMC 3654706 PMID 23479348
- ^ Gasteiger E, Gattiker A, Hoogland C, Ivanyi I, Appel RD, Bairoch A (กรกฎาคม 2546) "ExPASy: เซิร์ฟเวอร์สำหรับโปรตีนรู้ในเชิงลึกและการวิเคราะห์โปรตีน" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 31 (13): 3784–8. ดอย : 10.1093 / nar / gkg563 . PMC 168970 PMID 12824418 .
- ^ ExPASy: SIB Bioinformatics Resource Portal
- ^ Artimo P, Jonnalagedda M, Arnold K, Baratin D, Csardi G, de Castro E และอื่น ๆ (กรกฎาคม 2555). "ExPASy: SIB ชีวสารสนเทศทรัพยากรพอร์ทัล" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 40 (ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์): W597-603 ดอย : 10.1093 / nar / gks400 . PMC 3394269 . PMID 22661580
- ^ "ค้นพบ Expasy.org ใหม่สวิสชีวสารสนเทศทรัพยากรพอร์ทัล" พี่น้อง. สวิส. สืบค้นเมื่อ26 ตุลาคม 2563 .