บทความภาษาไทย

หมายเลขค่าคอมมิชชั่นของเอนไซม์

จำนวนเอนไซม์คณะกรรมาธิการ ( หมายเลข EC ) คือการจัดหมวดหมู่ตัวเลขโครงการสำหรับเอนไซม์ขึ้นอยู่กับปฏิกิริยาทางเคมีที่พวกเขาเป็นตัวกระตุ้น [1]ในฐานะที่เป็นระบบของระบบการตั้งชื่อเอนไซม์หมายเลข EC ทุกตัวจะเชื่อมโยงกับชื่อที่แนะนำสำหรับเอนไซม์ที่เกี่ยวข้อง

พูดอย่างเคร่งครัดตัวเลข EC ไม่ได้ระบุเอนไซม์ แต่เป็นปฏิกิริยาของเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยา หากเอนไซม์ที่แตกต่างกัน (เช่นจากสิ่งมีชีวิตต่างกัน) เร่งปฏิกิริยาเดียวกันก็จะได้รับหมายเลข EC เดียวกัน [2]นอกจากนี้ผ่านวิวัฒนาการมาบรรจบที่แตกต่างกันอย่างสมบูรณ์เท่าโปรตีนสามารถกระตุ้นให้เกิดปฏิกิริยาเหมือนกันและจึงจะได้รับการกำหนดหมายเลข EC เหมือนกัน (เหล่านี้เรียกว่าเอนไซม์ isofunctional ไม่ใช่คล้ายคลึงกันหรือ NISE) [3]ในทางตรงกันข้ามตัวระบุUniProt จะระบุโปรตีนโดยไม่ซ้ำกันตามลำดับกรดอะมิโน [4]

รูปแบบของตัวเลข

รหัสเอนไซม์ทุกตัวประกอบด้วยตัวอักษร "EC" ตามด้วยตัวเลขสี่ตัวคั่นด้วยจุด ตัวเลขเหล่านี้แสดงถึงการจำแนกประเภทของเอนไซม์ที่ละเอียดขึ้นเรื่อย ๆ หมายเลข EC เบื้องต้นมีอยู่และมี 'n' เป็นส่วนหนึ่งของหลักที่สี่ (อนุกรม) (เช่น EC 3.5.1.n3) [2]

ตัวอย่างเช่นtripeptide aminopeptidasesมีรหัส "EC 3.4.11.4" ซึ่งส่วนประกอบระบุกลุ่มของเอนไซม์ต่อไปนี้:

  • เอนไซม์EC 3คือไฮโดรเลส (เอนไซม์ที่ใช้น้ำเพื่อสลายโมเลกุลอื่น ๆ )
  • EC 3.4เป็นไฮโดรเลสที่ทำหน้าที่ในพันธะเปปไทด์
  • EC 3.4.11คือไฮโดรเลสที่แยกกรดอะมิโนขั้วอะมิโนออกจากพอลิเปปไทด์
  • EC 3.4.11.4คือสิ่งที่ตัดปลายขั้วอะมิโนออกจากไตรเปปไทด์

รหัสระดับบนสุด

หมายเลข EC ระดับบนสุด [5]
คลาส ปฏิกิริยาเร่งปฏิกิริยา ปฏิกิริยาทั่วไป ตัวอย่างเอนไซม์ที่มีชื่อเล็กน้อย
EC 1
Oxidoreductases 		เพื่อเร่งปฏิกิริยาออกซิเดชั่น / รีดักชัน การถ่ายโอนอะตอมหรืออิเล็กตรอนของ H และ O จากสารหนึ่งไปยังอีกสารหนึ่ง AH + B → A + BH ( ลดลง )
A + O → AO ( ออกซิไดซ์ )		 ดีไฮโดรจีเนสออกซิเดส
EC 2
การถ่ายโอน 		การถ่ายโอนหมู่ฟังก์ชันจากสารหนึ่งไปยังอีกสารหนึ่ง กลุ่มนี้อาจเป็นเมทิล -, อะซิล -, อะมิโน - หรือหมู่ฟอสเฟต AB + C → A + BC ทรานซามิเนสไคเนส
EC 3
ไฮโดรเลส 		การก่อตัวของผลิตภัณฑ์สองชนิดจากวัสดุพิมพ์โดยการไฮโดรไลซิส AB + H 2 O → AOH + BH เอนไซม์ไลเปส , อะไมเลส , peptidase , phosphatase
EC 4
Lyases 		การเติมหรือกำจัดกลุ่มที่ไม่ไฮโดรไลติกออกจากพื้นผิว พันธบัตร CC, CN, CO หรือ CS อาจถูกตัดออก RCOCOOH → RCOH + CO 2หรือ [X-A + BY] → [A = B + XY] ดีคาร์บอกซิเลส
EC 5
ไอโซเมอเรส 		การจัดเรียงใหม่ภายในโมเลกุลกล่าวคือการเปลี่ยนแปลงไอโซเมอไรเซชันภายในโมเลกุลเดี่ยว ABC → BCA isomerase , mutase
EC 6
ligases 		ร่วมกันสองโมเลกุลโดยการสังเคราะห์ของ บริษัท ใหม่งานบริการลูกค้า, CN หรือ CC พันธบัตรที่มีรายละเอียดพร้อมกันของเอทีพี X + Y + ATP → XY + ADP + P i ซินเธเตส
EC 7
Translocases 		เร่งปฏิกิริยาการเคลื่อนที่ของไอออนหรือโมเลกุลข้ามเยื่อหรือการแยกตัวภายในเมมเบรน ขนย้าย

ความคล้ายคลึงกันของปฏิกิริยา

ความคล้ายคลึงกันระหว่างปฏิกิริยาของเอนไซม์ ( EC ) สามารถคำนวณได้โดยใช้การเปลี่ยนแปลงพันธะศูนย์ปฏิกิริยาหรือเมตริกโครงสร้างย่อย (เดิมคือEC-BLASTปัจจุบันคือEMBL-EBI Enzyme Portal ) [6]

ประวัติศาสตร์

โครงการระบบการตั้งชื่อเอนไซม์ได้รับการพัฒนาโดยเริ่มตั้งแต่ปีพ. ศ. 2498 เมื่อรัฐสภาระหว่างประเทศด้านชีวเคมีในกรุงบรัสเซลส์ได้จัดตั้งคณะกรรมการเอนไซม์ ฉบับพิมพ์ครั้งแรกในปี พ.ศ. 2504 ฉบับที่ 6 ในปัจจุบันซึ่งจัดพิมพ์โดยสหภาพชีวเคมีและอณูชีววิทยาระหว่างประเทศในปี พ.ศ. 2535 ประกอบด้วยเอนไซม์ที่แตกต่างกัน 3196 ชนิด มีการเผยแพร่อาหารเสริม 1-4 ในปี พ.ศ. 2536-2542 ผลิตภัณฑ์เสริมอาหารที่ตามมาได้รับการเผยแพร่ทางอิเล็กทรอนิกส์ที่เว็บไซต์ของคณะกรรมการระบบการตั้งชื่อของสหภาพชีวเคมีและอณูชีววิทยาระหว่างประเทศ [5]ในเดือนสิงหาคม 2018 คณะกรรมาธิการเอนไซม์ได้จัดระบบการตั้งชื่อใหม่โดยเพิ่มหมวดหมู่ EC 7 ระดับบนสุดที่อธิบายการแปล [7]

ดูสิ่งนี้ด้วย

  • รายการหมายเลข EC
  • รายชื่อเอนไซม์
  • หมายเลข TC (การจำแนกประเภทของโปรตีนขนส่งเมมเบรน)

อ้างอิง

  1. ^ เวบบ์ EC (1992) เอนไซม์ศัพท์ 1992 คำแนะนำของคณะกรรมการศัพท์ของสหภาพนานาชาติชีวเคมีและอณูชีววิทยาในการตั้งชื่อและประเภทของเอนไซม์ สำนักพิมพ์วิชาการ. ISBN 978-0-12-227164-9.
  2. ^ ก ข "ENZYME (ฐานข้อมูลระบบการตั้งชื่อเอนไซม์)" . ExPASy สืบค้นจากต้นฉบับเมื่อ 21 มีนาคม 2019 . สืบค้นเมื่อ24 เมษายน 2562 .
  3. ^ Omelchenko MV, Galperin MY, Wolf YI, Koonin EV (2010). "Non-คล้ายคลึงเอนไซม์ isofunctional: การวิเคราะห์ระบบของการแก้ปัญหาทางเลือกในการวิวัฒนาการเอนไซม์" ชีววิทยาโดยตรง . 5 (1): 31. ดอย : 10.1186 / 1745-6150-5-31 . PMC  2876114 . PMID  20433725
  4. ^ Apweiler R, Bairoch A, Wu CH, Barker WC, Boeckmann B, Ferro S, Gasteiger E, Huang H, Lopez R, Magrane M, Martin MJ, Natale DA, O'Donovan C, Redaschi N, Yeh LS (ม.ค. 2004) . "UniProt: โปรตีนสากลคลังความรู้" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 32 (ปัญหาฐานข้อมูล): D115–9. ดอย : 10.1093 / nar / gkh131 . PMC  308865 PMID  14681372
  5. ^ ก ข มอสส์จีพี. “ ข้อเสนอแนะของคณะกรรมการระบบการตั้งชื่อ” . International Union of Biochemistry and Molecular Biology on the Nomenclature and Classification of Enzymes by the Reaction they catalyze. สืบค้นจากต้นฉบับเมื่อวันที่ 2018-09-10 . สืบค้นเมื่อ 2006-03-14 .
  6. ^ Rahman SA, Cuesta SM, Furnham N, Holliday GL, Thornton JM (ก.พ. 2014) "EC-BLAST: เครื่องมือในการค้นหาโดยอัตโนมัติและเปรียบเทียบปฏิกิริยาเอนไซม์" วิธีการธรรมชาติ 11 (2): 171–174. ดอย : 10.1038 / nmeth.2803 . PMC  4122987 PMID  24412978
  7. ^ Tipton, Keith (สิงหาคม 2018) "Enzyme Nomenclature News: Translocases (EC 7): A new EC Class" . ExplorEnz: แหล่งที่มาหลักของรายการเอนไซม์ IUBMB สืบค้นจากต้นฉบับเมื่อวันที่ 10 กันยายน 2018 . สืบค้นเมื่อ3 พฤศจิกายน 2561 .

ลิงก์ภายนอก
  • ระบบการตั้งชื่อเอนไซม์เว็บไซต์ที่เชื่อถือได้โดยคณะกรรมการระบบการตั้งชื่อของสหภาพชีวเคมีและอณูชีววิทยาระหว่างประเทศซึ่งดูแลโดย GP Moss
  • ฐานข้อมูลระบบการตั้งชื่อเอนไซม์ - โดยExPASy
  • รายการหมายเลข EC ทั้งหมด - โดยBRENDA
  • เรียกดูโครงสร้าง PDB ตามหมายเลข EC
  • เรียกดูโดเมน SCOP ตามหมายเลข EC - โดยdcGO
  • เปรียบเทียบหมายเลข EC โดยใช้ EC-Blast
  • Issoria lathonia.jpg พอร์ทัลชีววิทยา